Он работает в органах прокуратуры с 2007 года. Состоял в должностях: следователя прокуратуры Баунтовского района, следователя, заместителя руководителя Еравнинского межрайонного следственного отдела следственного управления Следственного комитета при прокуратуре РФ по РБ, заместителя прокурора Баунтовского района, заместителя Гусиноозерского межрайонного прокурора.

С февраля 2014 года Тимур Башкуев являлся заместителем Бурятского прокурора по надзору за соблюдением законов в исправительных учреждениях.